Pôle méthodologies et statistiques

Pôle méthodologies et statistiques

Mission du service

Le CESP s’est engagé dans une démarche de mutualisation de ses moyens techniques et humains dans les domaines de la méthodologie des études et enquêtes, ainsi que dans la gestion et l’analyse des données. Dans ce contexte, la principale mission du pôle méthodologies et statistiques est d’accompagner les chercheurs et cliniciens du CESP dans la mise en place, le suivi et la valorisation de leurs projets de recherche. En amont et en aval des projets, nos activités sont les suivantes :

Conseils Réglementaires

  • Soutien aux déclarations obligatoires : CPP, INDS, MR, CEEI
  • Aide à la rédaction des demandes de financements : appel d’offre, PHRC, PHRIP

Méthodologie

  • Conseil sur les méthodes d’enquêtes, le protocole et les questionnaires

Système d’information

  • Création de base de données et des outils de recueil électroniques associés

Exploitation des données

  • Gestion de base de données
  • Conseil dans le choix des méthodes d’analyses
  • Réalisation et encadrement de travaux d’analyses

Valorisation

  • Ecriture d’articles, rapports, communications orales et affichées

Contact

liste.methodologies.statistiques-cesp@inserm.fr

Guillemette Antoni (1 ETP) : Participation à la conception de projets de recherche clinique : aide au choix du plan expérimental, à l’estimation du nombre de sujets nécessaires, à la rédaction du projet ; Valorisation des données : analyses statistiques ; Conseil statistique.

Caroline Barry (0,5 ETP) : Co-responsable du pôle ; Participation à la conception/rédaction de projets de recherche en santé mentale ; Expertise et accompagnement méthodologique ; Valorisation et partage des données.

Christine Hassler (0,5 ETP) : Conseil règlementaire ; Conception de questionnaire ; Enquêtes Santé Mentale en milieu scolaire ; Développements méthodologiques

Angela Jackson (1 ETP) : Gestion de base de données ; Procédures qualité ; Sécurité des données ; Mission de conseil sur la collecte des données (scraping), le tri, la manipulation et la structuration de la donnée (data crunching). Définition et optimisation des bons moyens de stockage des données en adéquation avec les spécificités d’usage. Procédures qualité et sécurité des données.

Yves Koudou (0,5 ETP) : Réalisation de projets d’analyse ; Conseil statistique

Marie Metzger (0,5 ETP) : Co-responsable du pôle ; Coordination de la consultation statistique ; Conseil statistique ; Analyse et valorisation des données ; Correspondant formation scientifique pour le CESP

Mohamed Sedki (0,2 ETP) : Conseil statistique spécialisé : méthodes d'apprentissage supervisé en grande dimension (Méthodes de régression et classification pénalisées par lasso, ridge, etc, arbres de décision, gradient boosting, forêts aléatoires et SVM) ; Clustering et choix de modèles ; Conseil pour la parallèlisation de code R et conception de librairies R. 

Quelques projets en 2019

Conseils Réglementaires

  • Analyse d’impact (RGPD) pour la Cohorte Crespi - Epidémiologie respiratoire intégrative (N Le Moual)

  • CPP : Evaluation du devenir des adolescents et jeunes adultes reçus dans un dispositif de prise en charge précoce (ReFSEF) - Psychiatrie du développement et trajectoires (N Godart)

Appui méthodologique :

  • Projet ONISE Élaboration d'un outil numérique innovant pour enquêter auprès de jeunes sourds et malentendants - Psychiatrie du développement et trajectoires (F Labrell)

  • Aide au choix d'un plan expérimental pour un essai d'évaluation d'actions incitatives pour améliorer le dépistage du cancer du col de l'utérus chez des femmes socialement défavorisées et non suivies, dans le cadre d'appels d'offre (INCA et PREPS) - Sexualité et soins (V Ringa)

Suivi d’étude

  • Protocole et questionnaire Etude HASAFRA : Adaptation française du "health literacy assessment scale for adolescents" - Réseau REFLIS - Soins primaires et prévention & Psychiatrie du développement et trajectoires (V Ringa et A Rouquette)

Création/Administration BDD RedCap

  • Enquêtes Structures et Néphrologues de l’étude CKD REIN et base des expertises CV- Epidémiologie clinique (B Stengel)

  • Etude ancillaire Parkinson de l’étude E3N – Exposome et hérédité (M Canonico, A Elbaz, A Kowal)

Aide à la programmation logicielle

  • Simulation de plan factoriel avec double randomisation séquentielle - Oncostat (MC Le Deley)

  • Implémentation d'une procédure de validation croisée pour la sélection de variables pour un modèle de Cox pénalisé  - Epidémiologie des radiations (N Journy)

Mise en œuvre d’analyses statistiques

  • Meta-analyse sur données individuelles de facteurs pronostiques de cancers de l'ovaire - Gynecologic - Oncostat (X Paoletti, Cancer InterGroup Consortium)

Valorisation scientifique

  • Expertise scientifique réalisée par l'unité Inserm 1178 dans le cadre d’une convention entre la Direction Générale de la Santé et l'Inserm : « Evaluation de l’efficacité et de la sécurité de la cryothérapie du corps entier à visée thérapeutique » S. Ben Khedher Balbolia, C. Barry, C. Hassler, B. Falissard 2019

  • Association between cumulating substances use and cumulating several school, violence and mental health difficulties in early adolescents Chau K, Mayet A, Legleye S, Beck F, Hassler C, Khlat M, Choquet M, Falissard B, Chau N.. Psychiatry Res. 2019 Oct;280:112480.

  • "You have to believe in something": Risk of psychosis and psychiatrists' beliefs in the self-fulfilling prophecy. Benoit L, Russo T, Barry C, Falissard B, Henckes N. Soc Sci Med. 2019 Jun;230:20-29

Formations organisées en 2019-2020

  • R pour les data sciences  (M Sedki) : 25,26 et 27 mars 2019
  • SAS Perfectionnement (O Decourt) :  10, 12 et 13 septembre 2019
  • Optimisation programmation sous R (A Gillibert, 1 jour) : 24 septembre 2019
  • Prise en main REDCap (T Valero, 1 jour) : 4 octobre 2019
  • Visualiser des données avec R : introduction au package ggplots2 (H Panjo) : 24 avril 2020
  • Manipuler autrement des données avec R : introduction au Tidyverse (Y Koudou) : 11 mai 2020
Responsables
Localisation

Maison de Solenn, Paris

Hopital Paul Brousse, Villejuif