High-Dimensional Biostatistics

High-Dimensional Biostatistics

High-Dimensional Biostatistics for Drug Safety and Genomics (HiDiBiostat)

The team is interested in emerging statistical issues in public health and clinical research as access to and use of large-scale data increases. Drug safety assessment and predictive genomics are our two main areas of methodological development, both of which involve high-dimensional issues, notably with machine learning approaches.

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Our first axis is devoted to the evaluation of drugs in population, with methodological developments in pharmacoepidemiology and pharmacovigilance. We have a particular interest in vaccines and drugs taken during pregnancy. Our recent orientations also involve the exploitation of medico-administrative databases such as the National Health Data System (SNDS) in France. In pharmacoepidemiology, our objective is to develop statistical methods for the exploitation of SNDS data taking into account measured and unmeasured confounding. In addition, we are working on methods for estimating public health impact: the benefit-risk ratio of vaccines and attributable risk. In pharmacovigilance, we are developing methods for automatic signal detection aimed at exploiting the large databases of spontaneous reports and, more recently, of the SNDS. These methods are based on the statistical fields of high-dimensional variable selection and causality.

Our second axis carried by the Genostat group is devoted to predictive genomics and epidemiological genetics. The objectives are among others: (i) the development of integrative strategies that use various sources of "internal" (e.g. clinical samples) or "external" (e.g. databases) information, in particular internal multilayered information from genomics, transcriptomics and proteomics for prediction; (ii) the development of methods for association testing with rare variants, in particular for exome sequencing data.

Localisation

Hôpital Paul Brousse, Bat. 15/16

16 av, Paul Vaillant Couturier
94807 Villejuif


Membres

Ismail
AHMED
Chercheur.se
Biostatisticien.ne
Lucas
ANZELIN
Chercheur.se associé.e
Biostatisticien.ne
Jacques
BENICHOU
Chercheur.se
Biostatisticien.ne
Philippe
BROET
Chercheur.se
Co-responsable d'équipe
Emeline
COURTOIS
Chercheur.se
Biostatisticien.ne
Romain
DEMAILLY
Chercheur.se associé.e
Chi-Hong
DUONG
Doctorant.e
Biostatisticien.ne
Sylvie
ESCOLANO
Ingénieur.e ou technicien.ne
Biostatisticien.ne
Sidonie
FOULON
Doctorant.e
Biostatisticien.ne
Florence
GHESTEM
Doctorant.e
Biostatisticien.ne
Matthieu
HANF
Chercheur.se associé.e
Biostatisticien.ne
Iuliana
LAZA
Chercheur associé
Statisticien.ne
Anne-Louise
LEUTENEGGER
Chercheur.se associé.e
Biostatisticien.ne
Lucas
MORIN
Chercheur.se
Epidémiologiste
Astelle
NDIAYE
Doctorant.e
Epidémiologiste
Hervé
PERDRY
Chercheur.se
Biostatisticien.ne
Matthieu
PLUNTZ
Chercheur.se
Biostatisticien.ne
Catherine
QUANTIN
Chercheur.se
Epidémiologiste
Elise
QUENTIN
Ingénieur.e ou technicien.ne
Biostatisticien.ne
Yanis
SAIDI
Ingénieur.e ou technicien.ne
Biostatisticien.ne
Marc - Antoine
SANCHEZ
Doctorant.e
Médecin
Anne
THIÉBAUT
Chercheur.se
Biostatisticien.ne
Jean-JosuÉ
TOKPO
Doctorant.e
Epidémiologiste
Pascale
TUBERT-BITTER
Chercheur.se
Responsable d'équipe
Ana-Maria
VILCU
Chercheur.se
Biostatisticien.ne
Etienne
VOLATIER
Chercheur.se
Statisticien.ne

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Thèses soutenues

Développements méthodologiques pour l'étude du rôle des variants récessifs rares dans les maladies multifactorielles. Foulon, Sidonie; Perdry, Hervé; Leutenegger, Anne-Louise; Truong, Thérèse. []: université Paris-Saclay; 2022.
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Modélisation de l'impact d'une exposition médicamenteuse dans le temps : estimation de la fonction de risque et de la fraction de risque attribuable. Manitchoko, Liliane; Thiebaut, Anne; Benichou, Jacques. []: université Paris-Saclay; 2022.
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Abord de l'épidémiologie des cancers par des données de registre et des données médico-administratives : complémentarité des deux approches.. Simon, Julien; Quantin, Catherine. []: université Paris-Saclay; 2022.
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Critères d'évaluation de la validité des estimateurs d'intervalle de confiance. Gillibert, André; Benichou, Jacques; Falissard, Bruno. []: université Paris-Saclay; 2021.
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Détection automatisée de signaux en pharmacovigilance chez la femme enceinte à partir de bases médico-administratives Prescription drug use during pregnancy in France: a study from the national health insurance permanent sample Identifying drugs inducing prematurity by mining claims data with high-dimensional confounder score strategies. Demailly, Romain; Tubert-Bitter, Pascale. []: université Paris-Saclay; 2020.
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Score de propension en grande dimension et régression pénalisée pour la détection automatisée de signaux en pharmacovigilance Propensity Score-Based Approaches in High Dimension for Pharmacovigilance Signal Detection: an Empirical Comparison on the French Spontaneous Reporting Database New adaptive lasso approaches for variable selection in automated pharmacovigilance signal detection. Courtois, Émeline; Tubert-Bitter, Pascale. []: université Paris-Saclay; 2020.
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Étude de la composante génétique de la variabilité des infections palustres simples : Approche génome entier dans deux cohortes de jeunes enfants au Bénin First Genome-Wide Association Study of Non-Severe Malaria in Two Birth Cohorts in Benin Mixed logistic regression in Genome-Wide Association Studies. Milet, Jacqueline; Perdry, Hervé. []: université Paris-Saclay; 2020.
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Approches statistiques en pharmacoépidémiologie pour la prise en compte de facteurs de confusion indirectement mesurés dans les bases médico-administratives. Duong, Chi hong; Tubert-bitter, Pascale; Ahmed, Ismaïl. []: université Paris-Saclay; 2020.
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Sélection de variables et inférence statistique en grande dimension avec les régressions pénalisées : application aux données de notifications spontanées en pharmacovigilance. Pluntz, Matthieu; Tubert-bitter, Pascale; Ahmed, Ismaïl; Dalmasso, Cyril. []: université Paris-Saclay; 2019.
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Approches statistiques causales en grande dimension pour la détection de signaux en pharmacovigilance : application aux notifications spontanées et aux données médico-administratives. Volatier, Etienne; Tubert-bitter, Pascale; Ahmed, Ismaïl. []: université Paris-Saclay; 2018.
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