Biostatistique en grande dimension

Biostatistique en grande dimension

Biostatistique en grande dimension pour la sécurité des médicaments et la génomique (HiDiBiostat)

L'équipe s’intéresse aux questions statistiques émergeant en santé publique et en recherche clinique avec l'essor de l’accès aux données de grande dimension et de leur utilisation. L'évaluation des effets indésirables des médicaments et la génomique prédictive sont nos deux principaux axes de développement méthodologique. Ils impliquent tous deux des questions de grande dimension et font appel notamment à des approches d'apprentissage statistique.

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Notre premier axe est consacré à l’évaluation des médicaments en population avec des développements méthodologiques en pharmacoépidémiologie et en pharmacovigilance.

Nous avons un intérêt particulier pour les vaccins et les médicaments pris pendant la grossesse. Nos orientations récentes impliquent également l’exploitation des bases de données médico-administratives telles que le système national des données de santé (SNDS) en France. En pharmacoépidémiologie, nous avons pour objectif de développer des méthodes statistiques pour l’exploitation des données du SNDS prenant en compte la confusion mesurée ou non. Par ailleurs nous travaillons sur des méthodes d’estimation d’impact en santé publique : le rapport bénéfice-risque des vaccins et le risque attribuable. En pharmacovigilance, nous développons des méthodes de détection automatique de signaux visant à exploiter les grandes bases de données de notifications spontanées et plus récemment du SNDS. Ces méthodes s’appuient sur les champs statistiques de la sélection de variables et de la causalité en grande dimension.

 

Notre deuxième axe porté par le groupe Genostat est consacré à la génomique prédictive et à la génétique épidémiologique. Les objectifs sont entre autres : (i) le développement de stratégies intégratives qui utilisent diverses sources d'informations "internes" (par exemple des échantillons cliniques) ou "externes" (par exemple des bases de données) et en particulier des informations internes multicouches provenant de la génomique, de la transcriptomique et de la protéomique pour la prédiction ; (ii) le développement de méthodes relatives aux tests d’association avec des variants rares, notamment pour les données de séquençage de l’exome.

Localisation

Hôpital Paul Brousse, Bat. 15/16

16 av, Paul Vaillant Couturier
94807 Villejuif


Membres

Ismail
AHMED
Chercheur.se
Biostatisticien.ne
Lucas
ANZELIN
Doctorant.e
Biostatisticien.ne
Jacques
BENICHOU
Chercheur.se
Biostatisticien.ne
Philippe
BROET
Chercheur.se
Co-responsable d'équipe
Emeline
COURTOIS
Chercheur.se associé.e
Biostatisticien.ne
Romain
DEMAILLY
Chercheur.se associé.e
Chi-Hong
DUONG
Doctorant.e
Biostatisticien.ne
Sylvie
ESCOLANO
Ingénieur.e ou technicien.ne
Biostatisticien.ne
Sidonie
FOULON
Doctorant.e
Biostatisticien.ne
Matthieu
HANF
Chercheur.se associé.e
Biostatisticien.ne
Anne-Louise
LEUTENEGGER
Chercheur.se associé.e
Biostatisticien.ne
Lucas
MORIN
Chercheur.se
Epidémiologiste
Astelle
NDIAYE
Doctorant.e
Epidémiologiste
Hervé
PERDRY
Chercheur.se
Biostatisticien.ne
Matthieu
PLUNTZ
Doctorant.e
Biostatisticien.ne
Catherine
QUANTIN
Chercheur.se
Epidémiologiste
Elise
QUENTIN
Ingénieur.e ou technicien.ne
Biostatisticien.ne
Marc - Antoine
SANCHEZ
Doctorant.e
Médecin
Anne
THIÉBAUT
Chercheur.se
Biostatisticien.ne
Pascale
TUBERT-BITTER
Chercheur.se
Responsable d'équipe
Etienne
VOLATIER
Doctorant.e
Statisticien.ne

Recrutement

Emploi Affectation Type Date En savoir plus
Postdoctoral Position in Epidemiology Biostatistique en grande dimension Exposome et hérédité CDD 18 mois A partir de Lundi, juin 19, 2023 Consulter la fiche de poste

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[Child maltreatment and Covid-19: A crisis within a crisis]. Loiseau, Mélanie; Cottenet, Jonathan; Gilard-Pioc, Séverine; François-Purssell, Irène; Mikaeloff, Yann; Quantin, Catherine. Medecine Sciences: M/S. 2023; 39: p.64-67. doi:10.1051/medsci/2022201
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Comparison of cohort and nested case-control designs for estimating the effect of time-varying drug exposure on the risk of adverse event in the presence of ties. Manitchoko, Liliane; Abrahamowicz, Michal; Tubert-Bitter, Pascale; Benichou, Jacques; Thiébaut, Anne C. M.. Biometrical Journal. Biometrische Zeitschrift. 2023; 65: p.e2100384. doi:10.1002/bimj.202100384
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Time to onset of cardiovascular and cerebrovascular outcomes after hypertensive disorders of pregnancy: a nationwide, population-based retrospective cohort study. Simon, Emmanuel; Bechraoui-Quantin S, Sonia; Tapia, Solène; Cottenet, Jonathan; Mariet, Anne-Sophie; Cottin, Yves; Giroud, Maurice; Eicher, Jean-Christophe; Thilaganathan, Basky; Quantin, Catherine. American Journal of Obstetrics and Gynecology. 2023; : p.S0002-9378(23)00168-0. doi:10.1016/j.ajog.2023.03.021
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Incidence of new-onset type 1 diabetes during Covid-19 pandemic: A French nationwide population-based study. Mariet, Anne-Sophie; Petit, Jean-Michel; Benzenine, Eric; Quantin, Catherine; Bouillet, Benjamin. Diabetes & Metabolism. 2023; 49: p.101425. doi:10.1016/j.diabet.2023.101425
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Author reply. Goueslard, Karine; Jollant, Fabrice; Cottenet, Jonathan; Bechraoui-Quantin, Sonia; Rozenberg, Patrick; Simon, Emmanuel; Quantin, Catherine. BJOG: an international journal of obstetrics and gynaecology. 2023; : . doi:10.1111/1471-0528.17660
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Thèses soutenues

Développements méthodologiques pour l'étude du rôle des variants récessifs rares dans les maladies multifactorielles. Foulon, Sidonie; Perdry, Hervé; Leutenegger, Anne-Louise; Truong, Thérèse. []: université Paris-Saclay; 2022.
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Modélisation de l'impact d'une exposition médicamenteuse dans le temps : estimation de la fonction de risque et de la fraction de risque attribuable. Manitchoko, Liliane; Thiebaut, Anne; Benichou, Jacques. []: université Paris-Saclay; 2022.
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Abord de l'épidémiologie des cancers par des données de registre et des données médico-administratives : complémentarité des deux approches.. Simon, Julien; Quantin, Catherine. []: université Paris-Saclay; 2022.
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Modélisation dynamique des infections et co-infections génitales à papillomavirus humain (HPV) et de l’impact à long terme de la vaccination anti-HPV. Bonneault, Mélanie; Thiebaut, Anne; Opatowski, Lulla. []: université Paris-Saclay; 2021.
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Critères d'évaluation de la validité des estimateurs d'intervalle de confiance. Gillibert, André; Benichou, Jacques; Falissard, Bruno. []: université Paris-Saclay; 2021.
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Détection automatisée de signaux en pharmacovigilance chez la femme enceinte à partir de bases médico-administratives Prescription drug use during pregnancy in France: a study from the national health insurance permanent sample Identifying drugs inducing prematurity by mining claims data with high-dimensional confounder score strategies. Demailly, Romain; Tubert-Bitter, Pascale. []: université Paris-Saclay; 2020.
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Score de propension en grande dimension et régression pénalisée pour la détection automatisée de signaux en pharmacovigilance Propensity Score-Based Approaches in High Dimension for Pharmacovigilance Signal Detection: an Empirical Comparison on the French Spontaneous Reporting Database New adaptive lasso approaches for variable selection in automated pharmacovigilance signal detection. Courtois, Émeline; Tubert-Bitter, Pascale. []: université Paris-Saclay; 2020.
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Étude de la composante génétique de la variabilité des infections palustres simples : Approche génome entier dans deux cohortes de jeunes enfants au Bénin First Genome-Wide Association Study of Non-Severe Malaria in Two Birth Cohorts in Benin Mixed logistic regression in Genome-Wide Association Studies. Milet, Jacqueline; Perdry, Hervé. []: université Paris-Saclay; 2020.
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Approches statistiques en pharmacoépidémiologie pour la prise en compte de facteurs de confusion indirectement mesurés dans les bases médico-administratives. Duong, Chi hong; Tubert-bitter, Pascale; Ahmed, Ismaïl. []: université Paris-Saclay; 2020.
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Sélection de variables et inférence statistique en grande dimension avec les régressions pénalisées : application aux données de notifications spontanées en pharmacovigilance. Pluntz, Matthieu; Tubert-bitter, Pascale; Ahmed, Ismaïl; Dalmasso, Cyril. []: université Paris-Saclay; 2019.
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Approches statistiques causales en grande dimension pour la détection de signaux en pharmacovigilance : application aux notifications spontanées et aux données médico-administratives. Volatier, Etienne; Tubert-bitter, Pascale; Ahmed, Ismaïl. []: université Paris-Saclay; 2018.
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